呼尔满大捷后，清军一举扭转南疆战局，富德与兆惠合兵一处，黑水营之围亦解，南疆的清军实力为之一振，反观和卓叛军，他们以数万之众围困兆惠3000人，百日而不下，又在呼尔满之战中，被富德率领的清军重创，5000名最精锐的叛军主力伤亡殆尽，叛军士气跌落，双方攻守易形。而后各路清军也陆续南下，南疆的清军实力更加壮大，兵强马壮起来的兆惠遂着手开始筹备反攻事宜。
在兆惠的反攻下，清军接连攻取和阗、叶尔羌、喀什噶尔等重镇，大小和卓只得如丧家之犬一般仓皇西逃到拍米尔高原，试图利用帕米尔高原严酷的自然环境和漫长的后勤补给线，在那里与清军做长期周旋，兆惠本着“宜将剩勇追穷寇”的原则继续追击，并连续作战，打了三场漂亮的歼灭战，彻底打掉了大小和卓叛军的最后有生力量，将大清帝国的军旗插在了皑皑的帕米尔高原的雪山山。因帕米尔高原的古称为葱岭，是故称之为“葱岭三战”今天就来简单讲一讲葱岭三战的故事。
霍斯库鲁克之战。兆惠攻取喀什噶尔后，以绿营兵悍将闫相师率本部绿营兵留守喀什，同时以参赞大臣明瑞、爱隆阿等率兵追击大小和卓。乾隆二十四年闰六月十五日，明瑞、爱隆阿率2000清军，进入帕米尔高原的群山之中搜寻大小和卓。闰六月二十八日，明瑞的前锋部队900人在霍斯库鲁克岭，遭遇了大小和卓所部的6000人主力叛军。双方在此激战三个多时辰，清军大胜，斩首500余级，生擒30余人，清兵伤亡100余人。因为叛军人数众多，且清军因马匹劳累，无力继续追击，大小和卓得以继续西逃。
阿尔楚尔之战。乾隆二十四年七月初，富德、阿里衮与明瑞在喀喇乌苏会师，清军实力为之一振，富德从中拣选4000精骑，继续追击大小和卓。七月九日，清军在阿尔楚尔遭遇大小和卓叛军。富德以火器营、健锐营居中策应，以骑兵从两翼包抄迂回到和卓叛军侧后，切断其退路，并抢先夺取夺取南、北阿尔楚尔山制高点，对和卓叛军形成居高临下的有利态势。双方激战一整天，清军斩杀叛军1000余人，生擒50余人，阵斩和卓叛军大将阿卜都克勒木，叛军为之气泄。大小和卓只得带着残部仓皇再次西逃。
伊西洱库尔淖尔之战。乾隆二十四年七月十日，清兵尾随追击和卓叛军至阿尔楚尔以西的布隆库勒，清军哨探侦知大小和卓在布隆库勒湖东北的伊西洱库尔淖尔湖畔扎营。富德决定出其不意，再打他一仗。当时清军已经连续作战、疲惫至极，大小和卓怎么也想不到这些清军会如此“不离不弃”但富德真就是“不离不弃”，富德以阿里衮、达尔党阿、由屯、官长保、瑚什等清军悍将率军500，潜行西进，堵截大小和卓去路。七月十一日，富德带着巴禄、明瑞、阿桂、傅景、瑚尔起等清军悍将还有1000名精锐的八旗兵，抵达伊西洱库尔淖尔，随即发起了对和卓军大营的进攻。叛军在清军的攻势下，迅速崩溃，退路又被切断，纷纷向清军请降，大小和卓仅率妻子、奴仆三四百人逃亡巴达克山。
葱岭三战后，大小和卓的势力彻底退出了新疆，不久后在巴达克山被清军俘获，清军实现了对天山南北的全部掌控，乾隆实现了收复汉唐故土的千年夙愿，大清帝国的军功达到鼎盛。
