早期经历
于冲汉是清末秀才出身。1891年(光绪18年),他任县丞及直隶总督衙门文案。此后他到日本,在东京外国语学校任中文讲师。
1904年(光绪31年)日俄战争后,于冲汉任办理辽阳西部巡警事宜、辽阳交涉局局长。1910年(宣统2年),他任长春道台衙门帮办。翌年,他任奉天交涉司随办、辽阳知州。
1912年1月1日中华民国成立,于冲汉任外交部特派奉天交涉员、奉天巡按使署外交顾问。此后,他任张作霖所率第27师总文案,并任其外交顾问。1920年(民国9年),他任奉天官银号总办、东三省巡按使署总参议。同年8月,他任国务院参议。11月他奉张作霖之命作为特使前往日本。此后他任辽阳电灯公司总经理以及鞍山铁矿公司振兴公司总办。
1922年(民国11年),他任东三省保安总司令部总参议。1925年(民国14年),他升任东三省特别区行政长官。翌年,他转任中东铁路督办。1927年(民国16年)他辞职。1928年(民国17年),他任东三省保安总司令部参议。在张作霖手下,于冲汉在王永江死后和袁金铠被合称为奉天文治派的双璧。张学良继承张作霖大业后,因张学良同旧派疏远,故于冲汉政治的影响力渐失。
汉奸岁月
1931年(民国20年)九一八事变爆发,于冲汉得到关东军支持,任奉天地方维持委员会副委员长兼奉天地方自治指导部部长(长子于静远任该部自治训练处处长)。于冲汉很重视后一职位,宣传伪满洲国建国的理念。后来石原莞尔赞扬于冲汉是满洲国“建国最高功劳者”。此后于冲汉坚持绝对保境安民及不养兵主义,这成为伪满洲国断绝同国民政府的联系,独立建国的思想武器。
1932年(大同元年)3月,伪满洲国正式成立,于冲汉任首任伪监察院院长。
1932年11月12日,于冲汉在大连病死。