刘元珍（1571年－1622年），字伯先，号本孺，无锡人。明隆庆五年（1571年）出生于无锡城中时朗中巷附近。他家境贫寒，七岁丧母， 自幼勤奋好学。父刘升，历任山阳（今淮安）教谕、绩溪（今安徽绩溪县）校官等职。
人物生平
初入官场
刘元珍，出生于江苏无锡一个贫困家庭。万历二十三年（1595年）刘元珍在科举考试中考中进士。 一开始被授予南京吏部主事的职位，不久升为南京兵部郎中。后来因为父亲去世就回家丁忧。万历二十八年（1600年）补为南京兵部职方司郎中，主要掌管疆域图籍。他到任后，核审军需，淘汰年老或者羸弱的士卒，积极训练军队。一年中就节省了库银二万多两。
贬官外放
万历三十二年（1604年），由于有把柄掌握在礼部右侍郎郭正域等人手中，首辅沈一贯在私下里让他的心腹刑部给事中钱梦皋上疏：弹劾郭正域以及次辅沈鲤，并以所谓“妖书”案欲置沈鲤、郭正域于死地，但没有成功。
万历三十三年（1605年）适逢“京察”，吏部侍郎杨时乔、左都御史温纯等人揭露钱梦皋等人的劣迹，将他们列入了罢黜的名单之中。沈一贯却蛊惑神宗，说考察是不公平的，让皇上降旨将钱梦皋等人被罢黜的奏折都留中不发。 当朝廷中正直的官吏感到十分气愤，却畏惧于沈一贯的权势而不敢提出抗议时，刘元珍首先抗疏上奏。他认为自沈一贯成为首辅以来，奸邪的小人围绕在他的身边，假借皇帝的权利来满足自己的私欲，将国家大事在私下里做交易，欺君罔上，是对皇帝极大的不忠诚。近来看钱梦皋等人的奏章，每每都用是否与他们亲近来衡量同僚的能力。自古以来小人没有不先看是否结为一党而注重能力的。如今是治理叛乱安抚百姓的重要时机，不是考虑与人是否亲近的时候啊。奏疏陈上之后，神宗交与公卿大臣议论。沈一贯急忙为自己辩解，以减轻自己的嫌疑。钱梦皋也诋毁刘元珍，说他是温纯等人的爪牙。神宗都没有听信。
时隔不久，神宗以向言官效力的缘故贬刘元珍一秩（即十年），并将他调往边远地区任职。沈一贯假装要救他，给事中、御史侯庆远、叶永盛等也同沈一贯发生争执，神宗并未同意。吏部员外郎贺灿然、南京御史朱吾弼相继上疏，认为这次“京察”未能达到预期要求；兵部主事庞时雍也上疏指斥沈一贯的累累罪行。这些行为并没有扳倒沈一贯，反而使得神宗大怒，命将庞时雍、贺灿然连同刘元珍均贬三秩，降调至边远地区。御史侯庆远、李冉等人又挺身而出，申救他们，神宗不听。适逢御史周家栋直指时政弊端，因言语过于激烈，使得神宗迁怒于刘元珍等人，并将刘元珍等人除名削籍。虽然免去了钱梦皋等人职务，但沈一贯仍为内阁首辅。
讲学议政
刘元珍遭到罢免后回到家乡无锡，和顾宪成、高攀龙等人在东林书院讲学。这些人都是正直的官吏，对国家的命运十分关注，对当时黑暗的政治局面也表示出了极大的不满。他们常借探讨学问的机会，抨击时政。
起复回京
泰昌元年（1620）光宗继位，下诏起用原来因为进谏忠言而遭到贬谪、罢官的一些人。刘元珍因此被任命为光禄寺少卿。 在第二年（1621年）三月他抵达了京师。刚一上任，便接到消息说山海关外边事告急，明军被努尔哈赤军击败，辽、沈相继沦陷。
任上早逝
辽、沈相继沦陷时，前任赞画刘国缙以招募军队安抚百姓的名义，投书督饷侍郎，要求发登州、莱州（今山东蓬莱、掖县）船只，将这些难民南渡山东。刘元珍感到事有蹊跷，立即上疏反对。他说：“刘国缙原是辽东守将李成梁的义子。李成梁丢弃国土，本应受到严处，刘国缙却为了免除自己的过错而行贿，得免诛戮。后来杨镐出师辽东，但没有决心收复失地，却与守将李如柏密商，准备同努尔哈赤议和，设计陷害了主战将领刘廷，以至失地丧帅，两万多官兵倒于血泊之中。身为赞画的刘国缙却力保杨镐与李如柏。之后，刘国缙又倡议招用辽人，并自称征募士兵3万，领走了官府库银20余万两。可是却没有见到招募到的一兵一卒。刘国缙被弹劾离任之后，行动诡秘，不知道每天都做些什么。而在辽东全部沦陷，辽西危同累卵的时候，他却突然率领数万建军民，进入内地，想要前往山东。他究竟想干什么？非常使人担心。不久以前，清兵攻陷辽、沈，都是以已经投降的人为内应的。现今数万之众，难保没有清兵的奸细混杂于其间。如若让其深入山东，到时从内部发难，又怎么能防备呢？刘国缙过去就因为卖国而别免职，如今又对他委以招抚的重任，这岂不令人费解？自从辽东战事告急以来，为国捐躯的人得不到表彰，临阵倒戈者却反噬好人。这样忠奸不分，刑赏不明，国家又会怎么样呢？”
熹宗虽然将刘元珍的这份奏疏交给兵部议复，结果却不了了之。刘元珍本来身体强壮，此时却忽然一病不起。天启二年（1622年）逝世于京师官邸，终年仅51岁。
死后荣辱
天启五年（1625年），阉党横行，大兴冤狱，东林党人罹难。刘元珍虽已身故，但名字仍被阉党列入他们编造的所谓“东林党人榜”内，功名均被追夺。崇祯元年（1628年）才开始平反昭雪。
后人将他同顾宪成、高攀龙、顾允成，安希范、叶茂才、钱一本、薜敷教并称为“东林八君子”。
个人作品
《东林习静有感》
家族成员
父亲：刘升
人物评价
《明史》：表节义，恤鳏寡，行义重于时。
思想主张
同顾宪成等东林党人，提出反对矿监税使掠夺、减轻赋役负担、发展东南地区经济等主张，还主张开放言路、实行改良等针砭时政的意见。
