美国前总统肯尼迪遇刺身亡已有半个世纪之久，然而肯尼迪遇刺的一些谜团仍然未解，而最大的谜团是：到底是谁刺杀了肯尼迪?刺杀肯尼迪是一项阴谋吗?为何像美国这样科技高度发达的国家和严密的安保，肯尼迪却会被轻易的刺杀?
谜团1：
谁是刺杀肯尼迪的真正凶手?多年来有关刺杀肯尼迪的凶手及其背景不断发生变化，在1960年代，美国人认为苏联是刺杀肯尼迪的幕后元凶。到了1970年代，美国人则认为中央情报局才是幕后真凶。1980年代，美国人开始认为是黑手党下的毒手。到了现在，美国人则把矛头指向美国政府。肯尼迪遇刺在美国人心目中绝不是简单的一件谋杀案，人们对事件的看法反映了美国人的希望和担忧。
谜团2：
是否有第四次射击。根据政府的调查，整个刺杀行动发射了三颗子弹。几年后国会众院一委员会的调查称刺杀行动还有第四次射击，但这一结论被专家否决。
谜团3：
目击者为何会神秘死亡。一种流传的说法是，在肯尼迪遇刺后，一些目击者神秘地死亡。但实际上一些目击者是在提供证词后很久后死亡，大多数人死于心脏病，而在那个年代，心脏病是美国人的第一大死因。
谜团4：
政府是否隐藏肯尼迪遇刺的核心秘密?目前政府已公开了97%有关肯尼迪遇刺的文件，剩余的3%文件要在2017年才能公开，而这些未公开的文件是否有着真正的秘密目前知道的人极少。
谜团5：
肯尼迪家族为何要求保守秘密。肯尼迪遇刺后，其家族成员要求对肯尼迪住院和化验结果报告保持秘密，这引起人们的关注并怀疑肯尼迪家族试图掩饰什么。
谜团6：
美国政府为何将调查结果保密。1964年，调查委员会举行闭门调查，而一些调查结果也未公开。有一种说法，当年的副总统詹森涉及此案，但最后这也是一种传说。
谜团7：
神奇的子弹会转弯?有关肯尼迪中弹最离谱的说法是一颗子弹击中肯尼迪，然后这颗子弹两次转变方向并最后击中坐在前排的德州州长康纳利身上。子弹会转弯吗，结果还是众说纷纭。
谜团8：
肯尼迪遇刺电影为何成了权威史料?史东的电影“肯尼迪”被称之为破损的历史。史东是著名的电影制片人，他所拍摄的肯尼迪电影却是将事实和虚构混合在一起，这部影片有2000万美国人观看，而且还成为肯尼迪遇刺的官方记录影片。
谜团9：
枪手到底是几个人?一些研究显示，奥斯沃德不是唯一的枪手。这里的依据是奥斯沃德不可能在6.75秒内连发三枪。因此至少还有一名枪手开枪刺杀肯尼迪。而政府的报告称，经过训练的枪手可以在4.6秒内连发三枪，而5.6秒内连发三枪的枪手也不少见。而且受过训练的枪手在200至500码的距离可以做到指哪打哪，而肯尼迪遭到第一次枪击的距离仅为88码，最后一次枪击的距离为59吗。
谜团10：
为何枪手奥斯沃德刺杀肯尼迪的窗户不见了?1963年11月22日，奥斯沃德在达拉斯书库六楼的窗口射出三个子弹。在刺杀事件6年后，这座建筑的拥有者将刺杀现场的窗户换掉，并把这扇窗户装饰后挂在自己的庄园。不过有学者称，这扇窗户并不是建筑原始的窗户。
